Software udviklet af forskere ved Stanford University og Harvard University gør det muligt at finde ny viden gemt i forsøgsdata fra tidligere medicinske forsøg. Det skriver eWeek.
Forskerne har udviklet programmet Genotext, som kan søge i de store databaser med offentliggjorte forsøgsdata, som gen-forskere har offentliggjort.
De typiske forskningsmetoder inden for feltet skaber en stor mængde resultater, selv om forsøget har fokus på at finde en lille gruppe gener, der er ansvarlige for en funktion eller sygdom.
Genotext-programmet kan analysere de beskrivelser af de medicinske forsøg, som er offentliggjort sammen med forsøgsdata.
Beskrivelsen kan på den måde kædes sammen med en række definerede metoder, udstyr og andre begreber, som gør det muligt at udnytte data på tværs af forskellige forsøg.
- Forskere studerer blot en enkelt sygdom af gangen, så vi besluttede os for at finde ud af, om det er muligt at studere alt på én gang, siger Atul Butte, forsker i bioinformatik ved Stanford University, til eWeek.
Med Genotext kan de gamle forsøgsdata bruges til at finde frem til ny viden uden at udføre et nyt forsøg.
Selve resultaterne i databaserne følger en række retningslinjer, men problemet for forskerne var, at forskellige metoder og måder at beskrive forsøgene, gjorde det vanskeligt at sammenkæde data.
Derfor udviklede de Genotext, som automatisk forsøger at kæde forsøgsbeskrivelserne sammen med veldefinerede begreber.