EU-Kommissionen har fået medhold på næsten alle punkter i EF-domstolens afgørelse i Microsoft-sagen, men på et enkelt punkt havde dommer Bo Vesterdorf et klart rødt flag til EU's monopol-vogtere. I 2004 besluttede EU-Kommissionen, at der skulle udnævnes en ekstern ekspert, en såkaldt »monitoring trustee«, der skulle overvåge at Microsoft overholdt de krav, der blev stillet til firmaet.
EU-Kommissionen krævede, at Microsoft skulle sikre, at den uafhængige ekspert til enhver tid havde uhindret adgang til firmaets informationer, dokumenter, kontorer og medarbejdere. Og ikke mindst til kildekoden for firmaets produkter. Der blev ikke sat nogen tidsbegrænsning på, hvor længe denne adgang skulle opretholdes.
I sin afgørelse skriver EF-domstolen, at EU-Kommissionen har overtrådt sine beføjelser ved at forpligte Microsoft til at give den eksterne ekspert adgang til sine interne informationer. Det er kun EU-Kommissionen, der kan kræve at få indsigt i f.eks. kildekoden, og dette kan ikke overføres til en tredjemand.
»Domstolen konstaterer, at hvis Kommissionen vælger at søge assistance fra en ekstern ekspert, så kan den videreformidle alle informationer og dokumenter som den har modtaget gennem håndhævelsen af sine beføjelser. Men, ved at etablere en sådan monitoring trustee, med sine egne beføjelser til at efterforske og mulighed for at blive kaldt til handling af tredjeparter, er Kommissionen gået langt ud over den situation hvor den udpeger sin egen ekspert til at rådgive under en efterforskning,« hedder det i afgørelsen.
EU-Kommissionen har desuden pålagt Microsoft at betale alle omkostningerne i forbindelse med denne »monitoring trustee,« og det er klart i strid med EU-fællesskabets love, hedder det i EF-domstolens afgørelse. Derfor har EF-domstolen besluttet at annullere denne del af den oprindelige dom mod Microsoft fra 2004.