En af de mest interessante nyheder i Eudora 5.1 er understøttelse for Secure Sockets Layer (SSL), en teknologi, som skaber en sikker, krypteret forbindelse over Internet. SSL anvendes bl.a. til at kryptere elektroniske betalinger. Med Eudora 5.1 kan man også bruge SSL-beskyttelse, når man sender og modtager breve.
Qualcomm har også præsenteret en version af Eudora 5.1 til Mac OS X; denne udgave befinder sig dog stadig i beta-stadiet.
Blandt nyhederne i version 5.1 findes også nye funktioner i MoodWatch, et automatisk filter, der advarer dig hvis du prøver at sende "flames", muligheden for at importere indstillinger fra Netscape Messenger 6.0, stavekontrol til emnelinien, træk-og-slip understøttelse for vedhæftede filer og nye effekter til tekstformatering.
Eudora-brugere kan vælge mellem at betale 49,95 dollar for en reklamefri version af programmet, eller hente en gratis udgave, som viser reklamer i et vindue på skærmen. Qualcomm tilbyder også en gratis Light-version med begrænset funktionalitet, der ikke viser reklamer.
