I løbet af 2004 bliver det ikke længere muligt at kopiere musikfiler i MP3. Der er udviklet kopibeskyttelse, som skal forhindre kopiering af de populære musikfiler. MP3-formatet nyder i dag stor popularitet til deling af musik via fildelingstjenester som Kazaa.
MP3-formatets patentindehavere ønsker nu, at MP3-formatet også skal kunne benyttes til de nye populære online betalingstjenester, der i øjeblikket skyder op som paddehatte, eksempelvis iTunes og Napster. Det kræver, at filerne kopibeskyttes.
MP3, som har eksisteret siden 1993, har ind til for nyligt været den mest populære standard til lagring af musik, men møder nu hård konkurrence fra musikformater, som støttes af Apple og Microsoft. Salget af de nye musikformater har fået vind i sejlene i kraft af musikafspillere, som understøtter disse samt de nye legale online musiktjenester.
Kritikere påpeger, at kopibeskyttelsen kan betyde døden for MP3-formatet, når det ikke længere bliver muligt at bruge det til deling af musik via p2p-netværkene.
Kritikerne drager paralleller til Napster, der tidligere var et succesfuldt symbol på frihed og gratiskultur, men som efter at være transformeret til legal online musiktjeneste må kæmpe hårdt om markedsandelen for online salg af musik.
Mike Goodman, analytiker hos Yankee Group, vurderer, at det bliver svært for MP3-formatet at opnå accept i musikindustrien.
MP3-formatet har gjort sig upopulært i musikindustrien, fordi mange associerer det med illegal distribution af musik, netop fordi det hidtil har været uden indbygget kopibeskyttelse.