Partitionering med fdisk - hvordan udnytter jeg den mulighed bedst?

Jeg har en hartdisk på 3 GB som  nu igen efter 1½ år  er behæftet med så mange fejl, at det nok er nødvendigt at formatere den og geninstalere alle programmer og de dokumenter jeg gerne vil gemme.
Jeg overvejer ved den lejlighed at køre fdisk for at partitionere hartdisken.
Jeg er så usikker på, om jeg  kan nøjes med at have windows 98 liggende på den ene partition, og så have alle andre programmer liggende sammen med dokumenter  på den anden partition., så jeg om yderligere 1½ år kan nøjes med at geninstalere windovs når det går galt igen, for det kommer jeg  jo nok til, jeg er også usikker på om det overvejende er windows der giver problemer, når jeg får mange fejlmeldinger i stil med:
Setuup:
”Prgrammet har udført en ulovlig handling og afslutter. Kontakt programforhandler, hvis problemet fortsætter
Og under detaljer får denne fejlmelding:
SETUP forårsagede en ugyldig sidefejl i
modul SETUP.EXE på adressen 015f:006e8860.
Indhold af registrene:
EAX=ffaa9048 CS=015f EIP=006e8860 EFLGS=00010293
EBX=827b3c00 SS=0167 ESP=0091fe18 EBP=ffaa9048
ECX=00000005 DS=0167 ESI=004ef42f FS=4b1f
EDX=fff04ec1 ES=0167 EDI=0045be79 GS=0000
Byte ved CS:EIP:
8b 02 83 c2 04 89 07 83 c7 04 83 e9 04 77 f1 01
Indhold af stakken:
00401000 00000000 816e8524 0091ff78 0091fe3c 00810000 816e8584 816e8544 006e8790 bff8b537 00000000 816e8524 00810000 75746553 58450070 00000045”

Så er der en der vil give mig  en grundig vejledning, vil jeg være meget glad.
På forhånd tak.