Windows 2000 og master boot record

Hej,

Jeg har et lille problem. Tidligere havde jeg Windows 2000 på én disk og RedHat 7.0 på en anden. LILO lå på MBR.
Jeg blev træt af at have en Linux partition jeg aldrig brugte, så frem med PQmagic og væk med den. Sagen er nu den, at LILO stadig ligger på MBR og ikke er særlig nem at fjerne.
Windows 2000 disken har NTFS filsystem, så jeg er lidt bange for at boote på en Win98 bootdisk og køre fdisk /mbr
Jeg har forsøgt at køre Windows 2000 installationen igen og reparere boot sectoren, men uden hjælp. Derudover har jeg kørt installationen i \"konsol mode\" hvor der er en bootfix kommando, men den virkede heller ikke.
Hvad kan jeg gøre ved det??