Omstrukturering af database

Hej alle

Har forsøgt at søge efter dette problem og kunne ikke lige finde noget, så beklager på forhånd hvis jeg har misset det :)

Jeg har en database i MySql som er gammel (+12 år gammel) hvilket vil sige at strukturen i den er mildt sagt elendig - men ganske udmærket den gang :) 
Jeg vil lige indskyde at jeg ikke selv har opbygget den, den gang.

Nu bruger vi den til flere, store projekter, så det ville være dejligt med en "ny" database med ordentlige relationer og tabeller + at der ville falde lidt ro i mit sind :)

Mit spørgsmål er ret bredt: Hvordan skal vi tilgå denne opgave?

Vi vil gerne bibeholde dataerne, men de skal "omstruktureres".

Det jeg fisker efter er, om der er en "kendt" metode til dette, nogle effektive/nyttige Mysql funktioner som kan hjælpe mm., så vi ikke mister data og ikke skal kopiere hver celle-data ind manuelt eller lign. træls somme opgaver.

Håber I forstår spørgsmålet og at I kan guide mig på vej.