Opgradering ikke helt som planlagt

Jeg har opdateret min Domino server til Domino6, men tingene er ikke forløbet som jeg ville. Min SSL fungerer ikke mere, den siger at der ikke er et lokalt certificat. Så det har været umuligt at tjekke mails udefra. Ud over det lukker selve serveren ned på et tidspunkt om natten, og jeg måtte starte den igen imorges, og fandt ingen fejlmedd. ... er der nogen der kan hjælpe ?