Exchange 2010 Fejl... En udfordring??

Jeg har for 14 dage siden, lavet en opgradering fra vores gamle Windows 2000 server med Exchange 2003 til en ny Windows 2008 R2 med Exchange 2010. Migreringen forløb glat og uden fejl og alt har fungeret fint til i går.
Når jeg forsøger at connecte til Exchange via Exchange Shell får jeg denne fejl: http://www.fhn.dk/errors/error-01.png

Inde i IIS under default website ser det således ud:
http://www.fhn.dk/errors/iis-01.png - altså der mangler en hel del af de virtuelle mapper/apps til Exchange
Jeg er nået dertil, at jeg for at kunne genskabe de virtuelle mapper/apps til Exchange skal have PowerShell op og kører. Problemet er at jeg ikke kan få adgang da den laver denne fejl under IIS, når jeg vil se hvilke moduler der er registreret:
http://www.fhn.dk/errors/iis-02.png

Hvordan dette er sket og hvad jeg kan gøre for at få det til at fungerer er det store spørgsmål. Desværrer har jeg ikke mulighed for at gendanne ud fra en backup, da der har været problemer med en ustabil internet forbindelse og det er først blevet løst i dag. Så vores remotebackup har ikke kørt siden vi har taget den nye server i drift. Hvad gør jeg??