Eksekvering af boot time kommando

Hej med jer. Mit problem er som følger: Jeg har installeret Matrox's EZ-Bios for at mit bundkort kunne udnytte min 80gb hdd. Dette har dog betydet at når jeg booter fra en floppy, kan jeg ikke se mine harddiske. Normalt er dette ikke noget der generer mig, men da jeg tit skifter bootskærm og logonskærm er dette blevet et problem. Det kræver nemlig at jeg er i stand til at overskrive xp-kernen (ntoskrnl.exe). Dette kan jeg ikke gøre når windows er aktivt, så derfor må jeg vel kunne schedule en kørsel af en kommando eller en batfil jeg selv har lavet. XP gør det jo selv f.eks. når den scheduler en scandiskkørsel.
Håber der er nogen der ved noget!