Hvad er "korrekt" opbygning af hjemmeside anno 2012

Hej eksperter

Jeg har gennem årene kodet et mindre cms-system, men desværre er koderne i old-nordisk-stil med tabeller osv. ;-) Planen er nu at få det lavet om til css, hvor jeg har læst en masse om det på nettet, men ..... Det virker lidt uoverskueligt ;-)

Jeg vil derfor høre jer, hvordan jeg bedst griber det an, og hvor jeg finder rigtig god information omkring dette.

I dag er de bygget op som følgende eksempler:

http://www.rejser-rundt.dk (vandret menu)
http://www.weekendophold.com (lodret menu)

Indholdsdelen er "bokse" bygget ovenpå hinanden.

Har overvejet et grid-system ala http://cssgrid.net/, som umiddelbart vil passe godt på siderne med vandret menu, men kan slet ikke se, hvordan det kan passe på siderne med lodret menu.

Jeg er virkelig lost, så jeg håber, at I kan komme med nogle gode anbefalinger om, hvordan man anno 2012 "teknisk" bør opbygge en hjemmeside. Skal der specielt tages højde for css3 og html5?

På forhånd tak.