Script timer ud

Hej

Jeg har et problem med at jeg har et script der timer ud inden det når at blive færdig. Hvordan omgår jeg den timeout frist der er på et webhotel.

Jeg henter noget fra basen og så laver jeg en while løkke der skal igennem alt det jeg finder, og det kan den ikke nå inden timeout.

Håber der er nogle der lige har et forslag til en smart måde at løse det på.